鳄龟的食性比较杂，泥鳅、鱼、虾、蔬菜以及水果等食物都会吃。总的来说鳄龟是偏肉食性的食物。野外生存的鳄龟甚至还会捕食鸟类、蛇类。人工养殖的情况下，成年鳄龟可以投喂鱼、泥鳅、蚯蚓、龙虾、瘦猪肉等。

小鳄龟可以投喂小鱼苗、碎瘦肉、小龙虾、小蚯蚓和贝壳类的食物，也可以投喂碎苹果和碎菜叶。