公务员抚恤金是由单位发放的。公务员抚恤金是指公务员因公牺牲或因故病故时，由所在单位按照一定的规定发放的一种补贴。抚恤金的发放，主要是为了保障因故病故的公务员的基本生活和家庭困难的遗属的生活，体现国家对他们的关爱和优抚政策。

根据《中华人民共和国公务员法》第三十九条的规定，公务员因故病故的，所在机关应当给予抚恤。抚恤的具体办法由国务院规定。

因此，公务员抚恤金是由所在单位发放的，而不是社保发。