在建筑工程中，桩基施工通常是整个工程的一部分。根据《中华人民共和国建筑法》和相关建设工程合同法规，桩基施工是否可以由甲方单独发包取决于工程的规模、复杂性以及合同约定。

对于大型或复杂的工程项目，甲方可能会选择将桩基工程单独发包给具有相应资质的承包商，以便更好地控制工程质量、进度和成本。在这种情况下，桩基施工合同会作为整体建筑工程合同的一部分，或者是独立的合同存在。

然而，对于一些小型或简单的工程项目，甲方可能会选择将桩基工程包含在总承包合同中，由总承包商负责完成所有施工任务，包括桩基。

无论哪种情况，桩基工程的发包都必须遵守以下原则：

1. 发包方应当选择具备相应资质的承包商进行发包。

2. 发包过程应当公开、公平、透明，遵循相关的招标投标法律法规。

3. 合同条款应当明确，包括工程范围、质量标准、工期、价格及付款方式等。

4. 发包方和承包方都应当遵守合同约定，履行各自的权利和义务。

因此，甲方是否可以单独发包桩基工程，需根据具体情况和合同约定来确定，同时确保遵守相关的法律法规。