离职后以灵活就业人员身份交社保，原单位拖欠的社保部分能否补缴，需要根据具体情况而定。

一般来说，如果原单位拖欠的社保部分是个人已经缴纳的部分，那么原单位应该予以退还或补缴。如果拖欠的部分是单位应缴纳的部分，那么单位需要承担相应的法律责任，补缴相应的社保费用。

然而，如果离职后以灵活就业人员身份交社保，原单位可能无法再为您缴纳社保，因此原单位拖欠的社保部分可能需要由个人自行承担。

具体如何处理，建议咨询当地的社保部门或劳动监察部门，了解相关法律法规和政策，并寻求专业指导。