是的，深圳机场香港城市候机楼需要过关检查。根据相关法规，所有旅客在进入候机楼之前都需要接受安全检查和边防检查，以确保航班的安全和顺利进行。因此，无论是国内航班还是国际航班，都需要经过关检查，接受安检和边防检查。这些程序旨在保障航空安全，确保旅客和航班的安全，因此必须严格执行。