神山得名的传说，在今日有两种说法：

一是在乡民中流传较广的说法，以《广州市地名志》为代表，本书白云区神山村条说：「神山……相传宋代建村，因村旁原有一山岗称菩萨岭，故名」，这是说因山而名村。

另外一种说法，则说神山之得名，是因为一种神迹。一九六七年《香港番禺会所特刊》二二0页记载：『禺北神山墟，以附近双秀峰发现神迹而著其名。