主要在于申请流程、经营范围和监管要求上。

海关的营业执照是指在海关注册备案的企业，具有进出口业务的资格。申请海关营业执照需要经过一系列的审批流程，包括商务部门的对外贸易经营者备案、海关的海关企业注册备案等。海关营业执照的经营范围主要是进出口货物的收发货人。海关会对海关企业进行监管，确保其按照相关法规进行进出口业务。

本地营业执照则是指在本地注册的企业，经营范围通常限于本地市场。本地营业执照的申请流程相对简单，只需要在当地工商部门进行注册即可。经营范围主要取决于企业的注册地址和实际经营地址，需要与注册地址一致。

综上所述，海关的营业执照和本地营业执照在申请流程、经营范围和监管要求上存在区别。