深圳护照和港奥通行证可以同时办理，因为两者的用途和适用范围不同，不会相互干扰。深圳护照是一种国际旅行证件，适用于出境旅游、商务洽谈等；而港奥通行证则是一种赴港澳地区（包括香港、澳门和珠海）通行证件，适用于前往这些地区的短期旅游、探亲、商务等。因此，如果需要这两种证件，可以同时办理，保证自身的出行需求。