轮船上有专门的排污系统来处理废水。

海水会被吸入厕所的盆子或者马桶，之后人们进行排泄之后再利用真空排泄系统将废水排出船体。

在现代的豪华邮轮上，一些厕所还配备有刷卡式的智能系统，可以记录下每一位乘客在厕所里停留的时间和次数。