当铝合金门的滑轮轨道损坏时，可以考虑更换整条轨道或者修补轨道上的损坏部位。如果选择更换整条轨道，首先需要找到合适的尺寸和材质的轨道，然后将铝合金门卸下，并将新轨道安装好。

如果选择修补损坏部位，则可以使用金属胶或者打磨去除损坏部分，然后用填缝剂填充坑槽或者使用缝隙胶封住裂缝。需要注意的是，在处理铝合金门滑轮轨道时要保证操作的稳定性和安全性。