船用防锈油与木头透明漆的主要区别在于它们的用途和特性。

船用防锈油专门为防止五金件及电镀工件镀层变色而设计的工艺，经两到四分钟浸渍后，在五金制品或电镀镀层表面形成一层单分子膜厚度的防氧化保护层，依使用运输和储存条件的不同，在1—3年内可防止表面形成硫化物。这种油具有超强的耐硫化和耐盐雾性，通过各种腐蚀测试，具有超强的防锈效果。主要用于黑色金属制品长期封存防锈，尤适用于需要通过海洋运输及在盐雾环境下的封存防锈。

木头透明漆是一种用于保护木材并提升其美观度的涂料，通常用于家居装修中的木制家具、地板、橱柜等。它可以将木材原本的质感和纹理清晰地展现出来，让木材更自然、更美观。根据其成分和特性，木头透明漆可以分为油性、水性和酯类等类型。这些涂料不仅具有保护木材的作用，还可以增强木材的美观度。

总的来说，船用防锈油主要用于金属的防锈保护，而木头透明漆主要用于木材的美观和保护。两者在用途和特性上存在明显的差异。