政府租用耕地建农贸市场是否合法，回答当然是否定的。从根本上来说，政府的这种做法就是“以租代征”。以租代征是指未办理合法手续，私自将农用地转为建设用地的行为。　以租代征严重侵害农民的合法权益。按照《土地管理法》的规定，我国土地分为农用地、建设用地和未利用地，国家对不同用途的土地实行严格的管制制度。除兴办乡镇企业、村民建设住宅以及乡(镇)村公共设施和公益事业建设可以使用农民集体所有的土地外，其他建设用地必须使用国有土地。也就是说，如果想将集体土地作为建设用地使用就必须办理严格的审批手续，将该集体土地征收为国有。