是的，民办高校可以为教职工发放交通补助。这不仅是可能的，而且是合理和有益的。首先，发放交通补助是薪酬福利制度的一部分，可以帮助提高教职工的工作满意度和忠诚度。

其次，由于民办高校的特性，其教职工可能需要花费更多的时间和金钱在通勤上，因此，提供交通补助可以减轻他们的经济压力，提高他们的生活质量。

此外，这也有助于吸引和留住优秀的教职工，提高学校的教学质量和竞争力。

因此，民办高校应该根据自身实际情况，合理制定交通补助政策，以确保教职工的权益和福利。