拿到深圳入户指标卡后，应届毕业生需要先在户口所在地进行注销，然后携带入户指标卡、身份证、毕业证等材料到深圳市公安局出入境管理局办理入户手续。

办理入户手续包括填写申请表、提交材料、进行指纹采集等步骤，待审核通过后再领取身份证并办理其他相关手续。