流程如下：

1. 登录国家税务局网站或相关税务部门指定的网上申报平台，填写个人所得税申报表。

2. 填写申报表时，需要准备好相关的个人所得税收入证明、纳税证明、缴纳社会保险证明等相关材料。

3. 根据个人的具体情况填写申报表格，包括个人信息、收入情况、扣缴代扣代缴情况等。

4. 核对填写无误后，提交申报表格，并按照规定缴纳个人所得税。

5. 完成申报流程后需留意国家税务局网站或相关税务部门的信息公告，查看申报情况和缴纳税款的具体到账时间。

以上就是自然人代扣代缴短综合所得每年一月申报流程的基本步骤，具体申报流程还需要根据当地税收政策和要求进行操作。