要在昆山进行灵活就业医保的网上缴费，首先需要登录昆山社保网上服务平台。在平台上选择灵活就业医保缴费功能，填写相关个人信息和缴费金额。然后选择支付方式，可以使用网银、支付宝等进行在线支付。确认支付信息后，按照系统提示完成支付流程即可。

缴费成功后，系统会生成缴费凭证，可以保存或打印作为备份。通过网上缴费，方便快捷，避免了传统线下缴费的繁琐流程。