用方管焊两层的钢架房顶，可以按照以下步骤进行：

确定房顶的尺寸和结构：根据需求和建筑规范，确定房顶的尺寸和结构，并选择合适的方管材料。

安装底层钢架：按照设计要求，将底层钢架焊接在房屋的承重结构上。确保钢架水平、对齐，并具有良好的稳定性。

铺设次层钢架：在底层钢架上铺设次层钢架，次层钢架可以与底层钢架焊接在一起，也可以通过其他方式固定。确保次层钢架与底层钢架对齐，并具有良好的稳定性。

安装横梁和支撑：根据需要，在两层钢架之间安装横梁和支撑，以增加房顶的强度和稳定性。

焊接连接点：检查所有的连接点，确保焊接牢固。对于不牢固的连接点，进行必要的加固或重新焊接。

检查安全性：在完成房顶焊接后，进行全面的检查，确保房顶的安全性和稳定性。如果发现问题，及时处理。

喷漆防腐：为了增加方管的防腐性能，可以对焊接好的房顶进行喷漆处理。根据方管材料和使用环境选择合适的防腐涂料。

验收合格：最后，按照相关标准和规定进行验收，确保房顶符合要求。

需要注意的是，在进行房顶焊接时，要遵守相关的安全规定和技术标准，确保施工安全和质量。同时，如果对焊接技术不熟悉或不确定，建议请专业人员进行操作。