小红书小程序店铺和商城店铺的区别主要在于其经营模式和开店要求：

1. 经营模式不同：小红书小程序店铺主要是红人、博主等自媒体IP从事的推广营销，通过分享商品和推广链接进行佣金收入。而商城店铺则是由品牌方、零售商等自主创建的在线店铺，直接销售商品并获得收益。

2. 开店要求不同：小红书小程序店铺的开店门槛相对较低，需要绑定淘宝账号或微信支付宝账号等实名认证身份，即可开通推广权限。商城店铺则需要提供具有品牌授权或自主研发的优质产品，并且需要提前申请入驻小红书商城。

需要注意的是，无论是小程序店铺还是商城店铺，都需要遵守小红书的经营规范和法律法规。另外，开店前还要仔细研究小红书的政策和相关要求，以确保经营合法合规，并且能够取得良好的经营效果。