医保卡余额查询是零的原因主要可能有以下三种：

　　1、查询的方式不对

　　现在的医保卡一般都是一卡两用，分为医保个人账户和医保金融账户，如果没有向金融账户中存钱，那么在银行或者手机上查询，是不可能查到有钱的，余额自然为零。

　　如果是查询医保个人账户，可以去定点医院、药房、医保经办机构查询，或者是拨打社保热线12333查询，有时候也可以在手机上查询，譬如想查询南京医保个人账户余额，可以在“我的南京”中进行查询，可以看看当地是否有相应的查询工具。

　　2、医保机构还没有划账

　　如果拿到医保卡的时间还不长，查询余额时显示余额为0，那么可能原因是医保经办机构还没有正式划账，这种情况下，只要耐心等待即可。

　　3、参加的城乡居民医保

　　现在的城乡居民医保(包括新农合和城镇居民医保)正在逐步取消医保个人账户，要向门诊统筹账户过渡。因此参加城乡居民医保的参保人可能已经没有医保个人账户了，所以去查的话余额会是零元。如果之前里面还有钱的话，往往可以作为下一年的参保费用。

　　需要注意的是，有的地方医保卡和社保卡是一张，有的地方医保卡和社保卡是分开的，但不管是哪种情况，都是具备医保账户和金融账户，这两个账户之间相互独立，里面的资金不能互转。