沽源县下辖4个镇、9个乡和1个民族乡，即平定堡镇、小厂镇、黄盖淖镇、九连城镇、高山堡乡、小河子乡、二道渠乡、闪电河乡、长梁乡、丰源店乡、西辛营乡、莲花滩乡、白土窑乡和大二号回族乡。总计8个社区委员会、233个村委会。