天柱沟大峡谷景区距离红豆杉自然保护区约1小时30分钟车程。红豆杉保护区位于黄山风景区中部，面积约500公顷，拥有大量珍稀的红豆杉树木。而天柱沟则位于黄山风景区的南部，以其壮观的峡谷风光和瀑布群而闻名。虽然两者同属黄山风景区，但由于地理位置相距较远，驾车需要一定时间。