骆马湖的形成始于约1亿年前的燕山运动。1
在漫长的地质运动过程中,这里逐渐形成了一处凹陷洼地。南宋初年,黄河突然改道南下,夺取了泗水河在今日江苏境内的全部河道,滚滚洪流涌入淮河,流经苏北的大量洪水汇集到这片洼地之中,最终形成了骆马湖。