如果您发现小区附近有工厂臭味，您可以向以下部门或机构进行投诉：
环保部门：环保部门是负责处理环境污染问题的主要机构。您可以向当地的环保局或环境保护部门反映问题，他们会进行调查并根据相关法规进行处理。
市政部门：有些城市可能将环境保护的职责归属于市政部门，您也可以向市政部门投诉，他们会根据具体情况给出解决方案。
居民委员会或社区管理组织：作为居民代表的组织，居民委员会或社区管理组织也可以协助您向相关部门反映问题，并协调解决。
12345市民服务热线：您可以拨打市民服务热线，这是一个综合性的服务平台，他们会根据您的投诉内容，将问题转交给相关部门处理。
在投诉时，请尽量提供详细的信息，包括臭味出现的具体时间、地点、可能的源头以及对您生活造成的影响等。这样有助于相关部门更准确地了解情况并采取相应的措施。同时，您也可以要求相关部门对处理结果进行反馈，确保问题得到妥善解决。