如果京东店铺的商品被告侵权，首先需要收集证据，包括侵权行为的截图、侵权商品的链接等。然后，可以通过京东的投诉渠道向京东平台举报侵权行为，并提供相关证据。

京东平台会进行调查，并根据情况采取相应的处理措施，比如下架侵权商品、对侵权商家进行处罚等。同时，可以联系专业的知识产权律师，寻求法律援助，维护自己的权益。