根据教育部公布的最新名单，香港理工大学是经教育部认可的境外高等教育机构之一。该大学的制造系统工程硕士专业也是教育部认可的硕士学位授权类别，符合中国大陆硕士学位授权和认证的标准。因此，获得香港理工大学制造系统工程硕士学位的毕业生，在中国大陆的学历认证和就业等方面都应该是被认可的。但是，具体情况可能因个人情况、职业领域、用人单位要求等因素而有所不同，建议您在具体情况下咨询相关部门或单位，以了解该学历是否符合相关要求。