孔雀山隧道出现大量水的原因主要是因为隧道的地质条件复杂，存在大量的岩溶结构和裂隙，导致地下水流动量较大，同时隧道施工后的周边环境受到了影响，地下水位也有所改变，增加了隧道内的水压。

此外，隧道的排水系统不完善、水文地质勘察不够充分、经济考虑等都会导致隧道出现大量水的情况。

因此，在隧道施工及运营管理过程中，需要加强对地质环境的综合评价和水文地质勘察，同时加强隧道周边环境的监测和排水管理，以尽可能降低隧道出现大量水的风险。