琥珀的颜色主要是由于其中含有的含氧有机化合物和瑞士松脂的影响。琥珀是由数百万年前古树脂的化石形成，而古树脂内含有各种不同的有机物质，尤其是类黄酮物质，这些物质的存在决定了琥珀的颜色特征。

黄色的琥珀种类较多，这是因为它所含有的芳香族异戊二烯基类化合物与瑞士松脂化合物共同作用的结果。

琥珀透明的特性则是因为它的折射率非常高，当光线照射到琥珀表面时，琥珀会将光线折射到不同的角度，从而呈现出透明的质感。