地址不同，广州北站位于广州市花都区站前路1号，广州南站位于广州市番禺区石壁街道石壁村。

车站等级不同，广州北站是三等站，广州南站是特等站。

车站性质不同，广州南站是华南地区最繁忙的高铁站，是粤港澳大湾区、泛珠江三角洲地区的铁路核心车。