湛江至金城江的5539次列车途经的站点有：湛江、遂溪、廉江、文地、陆川、玉林、兴业、贵港、来宾、柳州、宜州、金城江。

以上信息仅供参考，具体列车时刻表可能会因时间而异，建议查询官方网站或咨询相关人士。