ISO系统启动U盘的格式是ISO格式。ISO格式是一种光盘映像文件格式，用于在计算机上创建光盘镜像并进行复制。使用ISO格式可以将整个光盘的信息打包成一个文件，并且这个文件可以被烧录到U盘中。

当需要启动计算机时，可以通过设置计算机启动顺序，使其先从U盘启动，从而启动ISO系统。因此，ISO格式是创建和启动系统U盘必备的格式。