安全专款专项的管理遵循《国家安全法》等法律法规。

这是因为《国家安全法》明确了国家安全的基本原则和指导思想，规定了国家安全的维护措施和责任制度。

安全专款专项是为了保障国家安全而设立的一项管理制度，必须遵循国家的法律法规。

此外，还需要遵循《关于进一步加强和规范中央和地方预算安全管理工作的通知》等文件的规定，强化安全专款专项的审核和监督措施，保障专款专项的使用安全和效率。

总之，安全专款专项的管理需要依据国家的法律法规，并且要在实践中积极探索和总结可行的管理经验，以保障国家安全和人民利益的最大化。