试用期辞职扣全勤是否合法，这主要取决于用人单位的相关规章制度。如果用人单位能够充分证明扣款是合理的，那么这种做法可能是合法的。然而，根据《工资支付暂行规定》第十五条，用人单位不得无故克扣劳动者工资。

因此，如果用人单位没有明确的规章制度支持扣款，或者扣款理由不充分，那么试用期辞职扣全勤可能是不合法的。在处理此类问题时，建议劳动者详细了解相关规定，并与用人单位进行沟通，确保自己的权益不受侵犯。