日本位于日本海的一些重要海港包括以下几个：

1. 新潟港：新潟港是日本海岸线上最大的国际港口之一，位于新潟市，也是日本重要的粮食、贵金属和化学品进口港口之一。

2. 青森港：青森港是位于东北地区的一个重要港口，主要负责木材、鱼类及其它农产品的出口。同时也是游轮停靠地点，有许多对乘客开放的设施和商店。

3. 釜山港：釜山港虽然不在日本境内，但也是日本重要的进口港口之一，位于韩国釜山市。

以上三个港口都紧靠日本海，且为日本重要的海上贸易门户。