是的，设备招标清单和合同清单在内容和形式上存在一定的差异。

设备招标清单通常是在招标文件中明确要求自主设计时，需要明确标明需要采购的一些设备、材料、工具等内容，以便供应商进行报价、参与投标。该清单通常包括设备名称、型号、规格、数量、技术参数等具体信息。

而合同清单则是在采购合同签订后，根据实际需求和约定的合同条款，由采购方和供应方共同确定的一份详细清单，主要用于约定双方的实际交货和付款等具体细节。

设备招标清单主要是为了招标采购流程中的供应商邀请和比价而准备的，而合同清单则更加关注采购过程中实际的设备交货、付款等安排。两者都非常重要，但是在不同阶段都具有不同的目的和内容。