巴布亚新几内亚城镇化率低的一个主要原因是该国地形复杂多样，多山丘陵和热带雨林覆盖了大部分的土地。这使得交通运输和通信困难，资源分散，经济发展严重不平衡。

此外，该国人口主要分布在农村地区，依赖农业生产为主要经济活动，缺乏城市工业基础设施和技术储备。

政府也缺乏城市规划和管理能力，难以有效地组织城市化进程，导致城市基础设施和公共服务严重不足，限制了城市发展。