家庭联产承包责任制的深化是指在原有家庭联产承包责任制基础上，进一步深化改革，从土地制度和农村经济结构两个方面入手，推进农村土地流转和承包经营权有偿退出制度的建立，鼓励农村经济组织发展，并加大对农业、农村和农民的扶持力度。这样可以增加农民收入、提高农业生产效率、优化农村产业结构，实现农业现代化。