京东小店通过1688代发的方式进行发货，属于一种第三方发货的模式。在这种模式下，当客户在京东小店下单后，商家需要支付采购款，然后由供应商直接发货给客户。客户签收后，京东会向代销商家结算。这个过程不需要商家自己囤货和发货，而是通过京东的平台连接到供应商，由供应商直接完成发货和服务。