农村自建房在一起分户可以按照以下步骤进行：
1. 共同商议：所有合法权属人员商议如何进行分户，包括分割的房屋面积、使用权、土地使用权等。
2. 测绘分割：请专业的测绘人员进行测绘分割，确定每一部分的所属权。
3. 提交相关材料：按照当地村委会或相关管理部门的规定，准备相关材料，包括分户申请书、测绘图、身份证明等。
4. 审批程序：将申请材料提交给当地政府或相关管理部门进行审批程序，等待审批结果。
5. 公告手续：依据审批结果，进行相关公告手续，将分户情况公告到相关单位。
6. 领取分户证：经过审批后，领取分户证，确认新的产权归属。