农民的耕地补贴每年的6月份发放。

这是因为耕地补贴是由每年的农业补贴资金中拨付的，而农业补贴资金的调拨通常是在当年的4月份结束，而耕地补贴的核算需要一些时间，因此在6月份发放比较合适。

另外，耕地补贴的发放周期也因地区而异，有些地区的补贴可能会在其他月份发放。