海关大学有两所：上海海关大学、中国海关管理干部学院。

1、上海海关学院

直属于中华人民共和国海关总署，是经教育部批准设立的具有高等学历教育招生资格的全日制普通高等学校。学校现设有海关与公共管理学院、海关与公共经济学院、工商管理与关务学院、海关法律系、海关外语系、公共教学部、马克思主义学院和检验检疫技术交流部等八个院系。

2、中国海关管理干部学院

是为海关队伍建设服务，为业务改革服务，为关警员成长成才服务，立足海关，服务海关，面向国际，建设具有海关特色的一流管理干部学院。