根据我国劳动法的规定，用人单位应当与员工签订劳动合同，并在其中约定企业内部的考勤制度、迟到早退和旷工处罚制度等规定，用人单位应当对该等制度的执行予以监督。如果员工旷工超过规定次数，用人单位应当依据劳动合同的约定予以相应的处理。

劳动合同法规定：用人单位应当与员工签订无固定期限劳动合同。双方可以签订固定期限劳动合同，但劳动合同到期前，企业内部必须满足法定解除劳动合同的条件。因此，如果按照劳动合同的约定，员工因旷工五天被视为自动离职，那么这种做法是合法的。但用人单位在制定考勤制度时，应该考虑到实际情况，符合法律法规及相关规定，并且需要根据具体情况处理员工的迟到、早退和旷工等情况，不能违反法律和劳动合同合法约定。