通常情况下，公积金首月还款银行会自动扣款。在贷款申请时，银行会要求借款人填写公积金还款账户，并在贷款通过后，自动将还款账户与公积金账户进行绑定，确保每月还款自动扣除。如果还款账户余额不足，银行会通过短信或电话提醒借款人及时充值。需要注意的是，如果还款账户余额连续多月不足，可能会影响个人信用评级。