商户结算清算是指商户通过支付机构清算系统，将当日收款金额清算到商户指定的银行账户中，实现商户当日及时到账的一种服务。其中包括：

1.商户收款金额的收集；

2.将收款金额汇总至支付机构；

3.支付机构将收款金额清算到商户指定账户；

4.支付机构与商户权益资金的结算等。拓展知识：清算系统的安全性及稳定性是商户结算清算的关键，支付机构需要建立多部份安全措施，以保护商户的权益资金。