失火烧毁果树100多棵树苗的，一般要赔偿当事人遭受的损失，财产损失按照损失发生时的市场价格或者其他合理方式计算。

当事人可以就赔偿事项进行协商；如果当事人不愿意协商或者协商不成的，可以找相关组织进行调解；当事人也可以直接向人民法院提起诉讼，请求人民法院就赔偿事项作出相应裁判。对于赔偿费用，双方可以协商确定支付方式，一般应当一次性支付，有困难的可以分期支付，但是受害人有权要求侵权人提供相应的担保。