阿合奇县位于新疆维吾尔自治区西部，天山南脉腹地，是中国领土不可分割的一部分。
阿合奇县地质构造复杂，矿产资源丰富，已发现的矿种有 30 余种，其中铜、金、铁、铅、锌、钨、锑、钼等金属矿藏储量居全疆前列。非金属矿藏中，盐、芒硝、石膏、石英砂等储量丰富。
阿合奇县地势西北高、东南低，海拔高程在 1730-5958 米之间，形成三大类型地貌，北部为高山区，海拔 3000 米以上，山峰终年积雪，是县内主要河流的发源地；中部为中山带，海拔 1500-3000 米，是县内主要农牧业区；南部为低山丘陵区，海拔 1100-1500 米，是县内粮、油、肉、蛋的重要产区。