团员档案遗失的原因可能有：

1. 文件整理不当：档案存放不规范，没有进行分类整理或者未放置在专门的存档盒中，容易造成档案遗失。

2. 涉及档案的人员流动：如负责管理档案的工作人员变动或离职等，导致档案管理不善从而造成遗失。

3. 意外事件：如火灾、水灾等意外事件发生，导致档案文件遭受损坏或遗失。

4. 盗窃或破坏：有人恶意盗窃档案文件或者对文件进行破坏。

5. 系统故障：存放档案的电脑系统出现问题或者数据丢失，造成档案遗失。

6. 不定期备份：档案没有及时进行备份，一旦遇到意外事件或系统故障，档案文件将无法找回。

7. 手误删除：管理档案的工作人员误删文件或档案，造成遗失。