贸易壁垒调查通常会导致调查对象国家或地区的出口受到影响。如果调查结果认定调查对象国家或地区实行了不公平的贸易壁垒措施,那么贸易限制措施可能会被采取。这些措施可能包括提高进口关税、禁止某些进口商品、实行出口管制等等。

如果商务部就台湾地区对大陆贸易限制措施进行贸易壁垒调查,并最终决定采取贸易限制措施,那么这将会对两岸贸易关系产生一定的影响。