黄金麝香龟和普通麝香龟是两个不同的品种，它们的主要区别在于外形、颜色及价值等方面。
1. 外形：黄金麝香龟体型较大，一般在20公分以上，背甲扁平而宽，呈深黄色，头颈呈橙黄色。普通麝香龟体型较小，一般在15公分以内，背甲微隆起，颜色为浅黄色，头颈颜色较暗。
2. 颜色：黄金麝香龟的外观呈深黄色，很少有棕色斑点，背甲上的纹路会产生亮黄色斑点。普通麝香龟的背甲颜色较浅，多为淡黄色或淡棕色，胶质的质地也比较明显。
3. 价值：由于黄金麝香龟的体型比较大、颜色美丽，且较为罕见，因此市场价格十分昂贵，而普通麝香龟则相对较为普遍，价格不高。