药店档案需要保存的资料包括：药品进货记录、销售记录、库存记录、药品质量检验报告、药品采购合同、药品许可证、药品说明书、药品价格调整通知、药品召回通知、药品销毁记录、药品投诉处理记录、员工培训记录、药店经营许可证、药店营业执照、药店税务登记证、药店安全生产许可证、药店卫生许可证等。

这些资料的保存有助于药店合规经营、追溯药品流向、保障药品质量和安全，以及应对监管部门的检查和审计。