黄豆鸟在笼子里死亡主要原因有以下几点：

一是环境的限制，笼子所在的空间狭小，没有足够活动和生存的条件，不能满足其正常的生理和心理需求；

二是饮食和营养不均衡，没有得到足够的食物和水分，缺乏必要的营养物质，导致身体健康受损；

三是感染病毒或者细菌等疾病，因为笼子环境的不卫生，导致黄豆鸟易感染疾病，加剧病情，导致死亡。因此，黄豆鸟应该生活在适合自己的自然环境中，享受自由自在的生活。